En 1572 Henri de Navarre (Henri IV) protestant se marie avec Marguerite de Valois fille de Catherine de Médicis catholique. Cette union devait réconcilier les catholiques et les protestants. Mais c'est le début du massacre de la Saint Barthélemy.

En 1595 la déclaration de guerre à l'Espagne permet de rassembler les catholiques et les protestants pour affronter nos ennemies. Le 13 avril 1598 est rédigé un édit royal dit de Nantes. Il instaure une coexistence à égalité des deux religions. Elle accorde aux huguenots la liberté d'ouvrir des écoles. Les enfants protestants sont accueillis par les écoles publiques.. Le roi reconnaît une centaine de places ce sont des villes fortifiées sous contrôle protestant. Ces villes sont la Rochelle, Montauban, Montpellier... Les conflits entre les religions sont arbitrés par des chambres rendant une justice équitable.